《巴啦啦小魔仙》讲述了来自人类世界的那些正义善良的小女孩们在机缘巧合下来到巴啦啦魔仙世界，在不同的魔仙世界里展开一段段精彩的故事，并帮助魔仙世界走出困境。 魔仙世界是一个拥有多个不同魔仙族群的平行世界，包括了拥有音乐魔法能量的魔仙堡、拥有色彩魔法能量的彩灵堡、拥有海洋魔法能量的海萤堡和冰岚城，以及拥有星瓣和星石能量的星缘堡等。